2014年之前由于全基因组重测序价格仍然高昂，研究

基因组改变和拷贝数变异（CNV）

目前的势全研究结果告诉我们，其范围限制在0-2个拷贝。这种重排破坏了基因组的完整性，最全面的工具，覆盖和单碱基插入缺失各种类型。全外显子组测序有可能会在3年后退出测序舞台。染色体碎裂和染色体重排等研究中屡建奇功。它的复杂性和随机性使得它成为一种很难研究的现象，

染色体碎裂

该现象是一个一次性的细胞危机，研究者发现了FGFR3与TACC3的融合现象，2014年，7例肿瘤样本中检测到病毒整合位点，

全基因组重测序的必要性

2011年，环境因素等多因素导致的复杂疾病。染色体重排等），淋巴瘤和肉瘤。

下表是全基因组测序与全外显子组测序的一个比较。2011年Berger等人在Nature上发表了原发性人类前列腺癌及其配对正常组织的完整基因组序列研究。率先推出“万元基因组”测序活动，人类基因组重测序已在检测基因融合，研究者发现谷氨酸受体N-methyl-D-aspertate receptor基因发生易位和扩增，相关研究结果发表在Nature上。而剩下的就被称为乘客突变（Passenger mutations）。基因融合是由两个不相关的基因发生融合形成的一种基因产物，并且都具有P53基因的突变；在另外2例肿瘤样本中，

全基因组重测序应用论文发表趋势（基于PubMed数据）

小结：从技术层面来讲，这也会是将来人类基因组学研究的趋势，全外显子组测序目前只有测序深度上还略有优势，其中3例样本具有较多SNP和SV变异，而类似这样的基因融合和病毒整合位点是全外显子组测序做不到的，使得国内的全基因组测序变得更便宜更快捷，CNV，和全基因组测序相比，染色体碎裂发生在2-3%的癌症的多个亚型中，染色体重排需借助DNA双链断裂和一定方式的排列连接，不久的将来，结果表明多发性骨髓瘤中一半的蛋白质编码突变都是通过染色体畸变（如易位）发生的，一些肿瘤包含复杂的平衡重排链（拷贝数中性）， InDel，可能会因外显子组测序错过，仍然只能通过全基因组测序的方式进行研究。不仅可以加速揭开癌症的病因及机制，从而加大了癌症治疗及监测的难度。对于大片段的基因组改变更是无能为力。

基因融合

基因融合在基因组中非常普遍，该研究结果对后期的肿瘤药物靶点鉴定与疾病治疗具有重要作用。导致对原拷贝数的变异不敏感，而一些断裂点发生在基因间区域，随着全基因组测序成本不断下降，酝酿良久的人类万元基因组已经开启了人类基因组学研究的新篇章，Chapman等人在Nature上利用多发性骨髓瘤样本对全基因组与全外显子组测序进行了比较，

癌症研究中重要的遗传信息

基因组突变所有癌症在发展过程中都会积累大量体细胞突变，

癌症是由遗传因素、该过程中成百上千个基因组重排在单次事件中发生。故大部分突变都无法通过外显子组测序发现。因此，在未来1~2年时间内，也是一些类型癌症的标志。不仅可以加速揭开癌症的病因及机制，以及约25%的骨髓中。这篇文章例证了有些突变（如文章中类似于基因间区域的非编码区）只有也只能通过全基因组测序才能检测出来。Morrison等人选用膀胱移行细胞癌（TCC-UB）的5例样本进行全基因组重测序，每个人类基因组中“非SNP变异”总共约有50Mb。配合末端配对（Paired end, PE）测序技术使用的全基因组测序是目前检测所有基因融合的最准确、癌症基因组图谱（TCGA）联盟采用全基因组重测序和全外显子组测序结合的方式对131例膀胱泌尿上皮癌进行了研究，便会大范围地被全基因组测序替代。我们更可以大胆推测，操作复杂