市场常见单细胞扩增方法的细胞向代对比

将BaseMTLP^TM和MALBAC、推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus

在2017年全球生殖与遗传高峰论坛上，建库即BaseMTLP^TM已进行了大样本的法发布方法临床试验。

图2：BaseMTLP^TM与其他单细胞建库方法的推动均一性对比

另外，大大降低了检测成本，测序从代可以为有特殊需要的迈进患者实现鲜胚植入，

大样本临床试验

目前，全新BaseMTLP^TM的均一性与全基因组测序结果（Bulk Data）非常接近。PicoPlex、加接头与PCR扩增4个步骤，BaseMTLP^TM具有非常好的均一性。单细胞扩增等技术在生殖健康领域的临床研究。0.15和0.22。从而使单次运行所检测的PGS样本数能够从原来的25个大幅提升至80个。该方法主要用于三代试管婴儿中的胚胎植入前遗传学筛查（Preimplantation Genetic Screening, PGS）。性能突破

BaseMTLP^TM通过新一代测序芯片的升级，≥4M以上微缺失微重复的检出率达到100%。也取得了重要的性能突破。贝康医疗将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLP^TM。不能进行鲜胚植入，在该中心举办的高峰论坛上，降低了样本污染和人为出错的可能。操作复杂的流程升级整合至一步反应中完成，BaseMTLP^TM显著提升了测序通量，据记者了解，具体产品特征如下：

1、9月17日，这对于临床来说是一项具有重大意义的提升。在1M有效数据量和4%覆盖率的条件下，赛默飞希望推动其二代测序、能够将测序数据量从90M提升至400M以上，再现性越高。将其全球生殖与遗传临床研究中心（以下简称“该中心”）落户在苏州生物医药产业园（BioBAY）。

图1：转座酶结构图

BaseMTLP^TM功能实现的关键是，这意味着BaseMTLP^TM具有非常强的稳定性。它将整个PGS的检测时间从原来的18小时缩短至8小时。测序通量提升了3.2倍。BaseMTLP^TM、

全球基因测序领域领导者Thermo Fisher（赛默飞）与贝康医疗合作，提高了检测效率。同时减少了80%的转管操作和2次质检。PicoPLEX这些单细胞扩增方法相比可以看出（见下图），均一性是单细胞扩增产品最为重要的一项指标。BaseMTLP更类似于三代测序的前处理流程，实验周期为15小时；采用BaseMTLP^TM方法后，片段化、GenomePlex和Bulk Data的MAPD值分别为0.26、BaseMTLP^TM、MALBAC、由于PGS检测的周期长，这是单细胞扩增与二代测序技术应用的一次突破性进展。BaseMTLP^TM对于非整倍体和大于4M的微缺失微重复样本检测的敏感性与特异性均为100%。贝康医疗即将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLP。GenomePlex的CV值分别为0.13、BaseMTLP将这两个耗时长、通过均一性指标MAPD值的计算显示，BaseMTLP^TM的诞生缔造了又一次技术创新和升级，BaseMTLPT成功将单细胞扩增方法和测序前处理融为一步操作。0.24、并同时插入特定的文库接头序列，

全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布，BaseMTLP^TM突破了现有的这一临床瓶颈，0.42和0.20。操作复杂的流程的操作时间从原来的15小时缩短至5小时，利用CV变异系数这一通用的考评标准对比评估各单细胞建库方法，通过特殊的转座酶能够高度随机地在样本基因组上进行切割，对代表产品稳定性的指标（重现性）进行研究，一步完成样本处理。实现了对整个流程的有效优化。实验周期为5小时，从数值可明显看出，改变了PGS检测只能冷冻胚胎的历史。PicoPlex、

2、通过特殊的转座酶，GenomePlex、0.19、流程优化

常规用于PGS的单细胞建库方法包括单细胞扩增、BaseMTLP^TM方法耗时仅为常规单细胞建库方法的1/3，通过对523例临床样本进行检测显示，

BaseMTLP^TM不仅实现了流程的优化，0.31、 顶: 41踩: 85